Nymphargus wileyi difiere de la mayoría de las especies por tener el dorso verde uniforme, peritoneo renal blanco, sin membranas entre los dedos III y IV. En la vertiente amazónica de los Andes, solo N. cariticommatus puede ser confundida con N. wileyi. Las diferencias entre estas dos especies son sutiles y pueden reflejar variación geográfica de una especie (ver detalles bajo N. cariticommatus). Nymphargus wileyi tiene el dorso uniforme (con pequeños puntos amarillos n N. cariticommatus) y tiene una línea débil de iridóforos cubriendo la parte anterior del esófago (peritoneo blanco cubriendo la mayor parte del esófago en N. cariticommatus). Nymphargus chancas, de Perú, tiene puntos amarillos diminutos; en preservante es gris apagado con puntos crema (lavanda uniforme en N. wileyi).

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(1) Espina humeral ausente; (2) hígado tetralobulado, cubierto por peritoneo transparente; (3) anterior 40-60% del peritoneo parietal ventral blanco, porción posterior transparente; pericardio blanco; peritoneo translúcido a opaco cubriendo intestinos, estómago, testículos, vesícula biliar y vejiga urinaria; (4) dorso verde pálido; huesos verdes; (5) en preservante, dorso uniformemente lavanda pálido; (6) superficie dorsal de machos y hembras levemente granular, pequeñas espículas presentes en machos; (7) hocico truncado visto dorsalmente, truncado a saliente visto lateralmente; (8) tímpano orientado casi verticalmente, con ligera inclinación lateral y posterior, diámetro 31.4-37.8% del diámetro del ojo; anillo timpánico visible anteroventralmente, membrana timpánica sin pigmentar y claramente diferenciada de la piel a su alrededor; (9) membrana ausente en los dedos internos de la mano; membranas reducidas en los dedos externos de la mano, IV 3-—22/3 V; (10) prepolex no separado del Dedo II de la mano; almohadilla nupcial Tipo I (sensu Flores, 1985); (11) Dedo III de la mano ligeramente más largo que el Dedo II (Dedo II 92-97% del Dedo III); (12) pliegue ulnar pequeño o ausente; pliegue tarsal interno pequeño y delgado, pliegue tarsal externo ausente; (13) fórmula de membranas del pie: I 2 — 21/3 II (11/3-12/3) — (21/2-3-) III (1+-2-) — (22/3-3-) IV (3-3) — (2-2) V; (14) superficie posterior ventral de los muslos con un par de tubérculos agrandados; (15) disco del Dedo III de la mano de tamaño moderado, 50-60% del diámetro de ojo; (16) vómeros sin dientes; (17) los machos cantan desde la superficie superior de las hojas; comportamiento de pelea desconocido; las hembras depositan los huevos en la punta de las hojas.

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Dorso verde pálido; flancos inferiores y vientre transparente; peritoneo parietal blanco cubriendo parte anterior del abdomen (corazón no visible); iris cobre blancuzco con reticulaciones negras; huesos verdes (Guayasamin et al., 2006).