Esta especie es más similar a P. conspicillatus y P. peruvianus, ambas tienen flecos pequeños y pálidos en la superficie posterior de los muslos, pero ambas difieren de P. metabates por no tener membranas entre los dedos de los pies y usualmente tener máscaras oscuras en el rostro; P. peruvianus tiene un moteado oscuro en la región gular y el pecho. Estructuralmente P. malkini es similar a P. metabates, pero tiene más membrana entre los dedos de los pies y un moteado negro y crema en la superficie posterior de los muslos. P. fenestratus, rhabdolaemus y vilarsi tienen la superficie posterior de los muslos café uniforme; P. lnthanites tiene la región gular gris con una línea media blanca y un tubérculo prominente en el talón y P. vilarsi tiene piernas proporcionalmente más cortas y un tímpano más grande. Otros miembos más peueños de los grupos P. conspicillatus y P. peruvianus en Perú difieren en estructura y coloración. P. buccinator tiene puntos rosados en la ingle y superficies ocultas de los muslos y P. avicuporum y P. skydmainos tienen un pliegue interocular. P. cuneirostris difiere de P. metabates por tener el hocico en forma de cuña y muchos puntos café oscuro redondos en el dorso. P. adiastolus, albertus, bipunctatus, danae, pharangobates, reichlei, rhabdolaemus, sagittulus, stictogaster, toftae y taynrhynchus todos difieren de P. metabates en la coloración y por tener piel areolada en el vientre (Duellman y Lehr 2009). Dentro de las especies grandes del grupo P. conspicillatus en Ecuador y Perú, la región ventral en P. condor es blanco crema con una pigmentación densa gris en la región gular, vientre y superficies ventrales y posteriores de los muslos son café con puntos pálidos. En P. lymani, el vientre es sin pigmentar, excepto por barras oscuras en los márgenes del labio inferior y posterolateramente en la región gular; la superficie posterior de los muslos es negra con moteado crema. En P. citriogaster el tubérculo palmar es redondo en vez de bífido y el vientre es amarillo con moteado gris o café en la región gular, lateralmente en el vientre y en la superficie ventral de los muslos; la superficie posterior de los muslos es moteado café oscuro y café claro crema (Duellman y Lehr 2009).

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(1) Piel dorsal lisa con tubérculos poco definidos, cientre liso; pliegue discoidal prominente; pliegues dorsolaterales ausentes; (2) membrana timpánica lisa; anillo timpánico prominente, verticalmente ovoide, menos del 50% del tamaño del ojo; (3) hocico moderadamente largo, redondeado visto dorsal y lateralmente; (4) párpado superior con numerosos tubérculos pequeños y bajos, párpado tan ancho como la distancia interorbital; crestas craneales ausentes; (5) proceso dentígero de los vómeros prominentes y ovales; (6) machos con hendiduras vocales; sin almohadillas nupciales; (7) Dedo I de la mano ligeramente más largo que el II; discos de los dedos externos de la mano expandidos, truncados, del doble del ancho del dígito proximal a la almohadilla; (8) dedos de las manos con rebordes laterales angostos; (9) tubérculos ulnares ausentes; (10) talón y borde externo del tarso sin tubérculos; borde interno del tarso con pliegues distales distintivos; (11) tubérculo metatarsal interno elevado, elíptico, tubérculo metatarsal externo subcónico 10x; tubérculos plantares supernumerarios ausentes; (12) dedos de los pies con rebordes laterales anchos; membrana basal; Dedo V del pie ligeramente más largo que el III, discos ligeramente más pequeños que los de los dedos externos de las manos; (13) dorso café con una X oscura desteñida o marcas en forma de chevrones; vientre crema con flecos café difusos en la región gular; superficie posterior de los muslos café con pequeños flecos crema.

Desconocido (Duellman y Lehr 2009).