Pristimantis pteridophilus se distingue de las demás especies de Pristimantis del occidente ecuatoriano por no tener características sexuales secundarias y por tener el Dedo V del pie extremadamente largo. En patrón y algunas características de tubérculos se parece a P. verecundus. P. siopelus también es similar a P. pteridophilus, pero no tiene anillo timpánico.

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(1) piel dorsal lisa en machos, con tubérculos esparcidos en hembras, vientre areolado; pliegue discoidal presente; pliegues dorsolaterales ausentes; (2) membrana timpánica ausente; anillo timpánico presente, su tamaño 1/4 - 2/5 del tamaño del ojo; (3) hocico corto, subacuminado visto dorsalmente, redondo visto lateralmente, con una quilla lateral; (4) párpado superior con tubérculos, más angosto que la distancia interorbital; crestas craneales ausentes; (5) odontóforos vomerinos ovales; (6) machos sin sacos bucales ni almohadillas nupciales; (7) Dedo I de la mano más corto que el II; dedos II-IV con discos grandes y redondos; (8) dedos de la mano con rebordes laterales carnosos; (9) tubérculos ulnares pequeños y cónicos; (10) talón y borde externo del tarso con pequeños tubérculos; borde interno del tarso sin tubérculos o pliegues; (11) tubérculo metatarsal interno oval, tubérculo metatarsal externo subcónico 4-6x; tubérculos supernumerarios en la base de los pies; (12) dedos de los pies con rebordes laterales; membranas ausentes; Dedo V mucho más largo que el III; (13) dorso pálido a café con marcas oscuras delineadas de crema; vientre crema con flecos café formando reticulaciones; superficie posterior de los muslos café con moteado crema.

Dorso verde, café claro, café amarillento o café rojizo; costado de la cabeza, flancos y superficies ocultas de las piernas lavados de amarillo. Región gular color carne y vientre blanco amarillento; iris es cobre rojizo con flecos negros.