Esta especie se reconoce de las demás dentro del género Pristimantis de als tierras bajas del oeste ecuatoriano por tener puntos amarillos en las ingles y la superficie posterior de los muslos. La única otra especie similar es P. luteolateralis, que tiene una distribución limitada en el bosque nublado de la Provincia de Pichincha, Ecuador. P. luteolateralis siempre tiene un patrón dorsal pálido con líneas oscuras, mientras que P. walkeri es polimórfico en cuanto al patrón dorsal.

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(1) piel dorsal levemente granular, vientre areolado; pliegue discoidal prominente; pliegues dorsolaterales ausentes; (2) membrana timpánica y anillo timpánico prominentes, su longitud 1/3 del tamaño del ojo; (3) hocico subacuminado visto dorsalmente, redondeado visto lateralmente; (4) párpado superior sin tubérculos, ligeramente más angosto que la distancia interorbital; crestas craneales ausentes; (5) odontóforos vomerinos ovales; (6) machos sin sacos vocales ni almohadillas nupciales; (7) Dedo I de la mano más corto que el II, discos grandes no emarginados; (8) dedos de las manos con quillas laterales; (9) tubérculo ulnar escondido o ausente; (10) talón sin tubérculos, borde exterior del tarso con tubérculos débiles; borde interior del tarso con un tubérculo pequeño; (11) tubérculo metatarsal interno oval, tubérculo metatarsal externo cónico 5-6x; pocos tubérculos supernumerarios; (12) dedos de los pies con rebordes laterales; membrana ausente; Dedo V del pie mucho más largo que el III; (13) coloración dorsal polimórfica con o sin líneas dorsolaterales pálidas; vientre crema con flecos café; superficie posterior de los muslos café, con o sin áreas negras rodeando puntos crema; ingles negras con puntos crema (amarillos en vida).

Existen varios morfos: Morfo A: barra interorbital, chevrones escapulares y sacrales y una barra lumbar. Flancos y costados de la cabeza no más oscuro que el dorso y la parte superior de la cabeza. Morfo B: flancos y costados de la cabeza mucho más oscuro que el dorso y la parte superior de la cabeza; línea vertebral oscura desde la punta del hocico hasta la cloaca bordeado por una línea oscura paravertebral; chevrones y barras ausentes. Morfo C: como en A excepto por una fina líneavertebral crema bordeada de café oscuro pasando a través de los chevrones y barras. Morfo D: como en A excepto por unas líneas anchas dorsolaterales crema pálido; chevrones y barras presentes entre las líneas dorsolaterales. Estas variaciones son evidentes en los siguientes especímenes: KU 120215-20 de Santo Domingo de los Colorados: Pichincha: dorso y extremidades grises, café, oxidado o negro con marcas negras; algunos individuos con manchas café; los que son color oxidado posteriormente son café posteriormente (individuo negro con puntos blancos); vientre negro apagado, gris o crema; saco vocal amarillo; ingle gris oscuro con puntos amarillo limón; superficie posterior de los muslos gris; línea crema sobre el vientre; iris gris con reticulaciones negras con tendencia a tener una línea media horizontal café. KU 131613-27 de Balzapamba, Bolívar: dorso gris oscuro a negro con marcas negras o flecos crema; vientre gris oscuro con flecos grises más pálidos; ingles y superficies ocultas de las piernas con puntos amarillo limón; algunos individuos con una línea dorsolateral ancha; iris café con algunos flecos negros y una línea media horizontal café. En Santo Domingo de los Colorados, algunos individuos tienen puntos naranja en vez de amarillos en la ingle y superficie posterior de los muslos.